Отсутствие опыта - это не самое плохое качество госслужащего. Его же не министром назначили... 
Заместитель министра, как правило, курирует определенную службу министерства, или блок служб, или направление деятельности. Это значит, что он отвечает за организацию работы в этом направлении, то есть, минимум, должен ориентироваться в вопросах, которые решают его службы, а максимум, обязан организовать работу подчиненных. В отличие от министра, который является, в первую очередь политической фигурой, заместитель уже является функционером. Министру можно и не быть специалистом, для этого у него есть штат заместителей и помощников, которые, если че, подскажут, а вот заму уже надо немного в вопросах разбираться.
