1. разные алгоритмы работы поисковиков
2. разные "сео-манипуляции" для разных поисковиков (более подробно можно сказать, узнав сам тип "манипуляций")
профи ещё добавят свои варианты
P.S. по п.2: например, если вы используете для продвижения другие сайты, то у них ТИЦ может быть 2000, а PR = 0